突变率与核小体的关系

The Structure of Change

Colin A. M. Semple, Martin S. Taylor. The Structure of Change. Science 323, 347-348 (2009)

1、基因组不同位置突变率不同，现在又发现核小体结构使得突变增加。
2、Sasaki et al以鳉鱼（Oryzias latipes）两个品系为材料，进行全基因组比对，共分析了11654个转录起始点和37.3million个核小体位置，发现转录起始点附近突变率（置换＋插入/缺失）以200bp为周期上下波动，恰好与核小体出现的位置相一致。
3、置换率与indel率的周期相反，例如在连接区（linker sequence,简称间区），indel频率最高时置换率最低。
4、可能的两种解释：
（1）核区和间区突变率本身就不同。
（2）核区和间区突变率相同，但自然选择作用更多地排除了间区的突变。

5、Sasaki et al更倾向于第一种解释：（1）核区与间区核苷酸组成不同。（2）核小体要精确定位需要间区保守。